クラスタでのMVPの走らせ方
$HOME/moderatorにMVPの入出力ファイルを置くとする。
$ mkdir $HOME/moderator
$ cd $HOME/moderator
$HOME/moderator以下に下記の(1)(2)の2つのファイルを用意する。
(1) $HOME/moderator/mvp.input
MVPの入力ファイル
(2) $HOME/moderator/mvp.sh
MVPを実行するためのシェルファイル。以下のように記載する。
#!/bin/csh
setenv MVP_DIR /usr/local/MVP-GMVP/mvp-3.0
setenv MVPLIB_DIR /work2/MVPlib
setenv MVPHOST LINUXGLIBC
setenv MVPBURN_NIDX /work2/MVPlib/neutron.art.J40.index
/usr/local/MVP-GMVP/mvp-3.0/etc/runmvp $HOME/moderator/mvp.input
PBSジョブスケジューラを使ってジョブを投入する方法
$ cd $HOME/moderator
$ qsub ./mvp.sh